Ma mentre installavi hai staccato gli altri? In questo caso potrebbe avere installato GRUB nel disco sbagliato e poi tu booti da un'altro.
La cosa migliore è fare come ti ha detto Tyler, in tal modo sovrascrivi il MBR andando "sopra" a quello di Windows.
Se invece vuoi mantenere un dual boot devi prima installare Windows e poi Ubuntu, in caso contrario il bootloader di Windows non ti farà lanciare Linux (a meno di modifiche manuali)...
