Prima di tutto dicci il tuo sistema (cpu, HDD ecc..).

Può essere un probelma di lettura/scrittura sull'HDD. Micapitava la stessa cosa con FEAR conil vecchio pc.
Prova a fare tutte le scansioni del caso.
Inoltre quello chemi viene in mente è che possa avere qualche processo che si carica in background e che consumi cpu.